Certaines sections thématiques sont préservées, comme la reconstitution d'une ancienne épicerie, des collections présentées dans leur intégralité, la section des sols en majolique et celle des plaques votives.
La section contemporaine est principalement constituée d’œuvres provenant du Multiplo d’Artista in Maiolica et du Prix Deruta ; la section archéologique offre quant à elle un panorama significatif des principaux types de vaisselle produits dans l’Antiquité et rassemble des objets en céramique grecque, italiote, étrusque et romaine.
Une imposante tour métallique de quatre étages, abritant plus de 4 500 œuvres, constitue la section réservée aux réserves, entièrement accessible au public.
Depuis 2013, le parcours de visite comprend également la zone archéologique des fours de San Salvatore ; les fouilles archéologiques, achevées en 2010, ont mis au jour une série de structures datant de la fin du XIIIe siècle au début du XVIIIe siècle et ont permis la mise au jour d’un nombre important de vestiges céramiques.
Aujourd'hui, un tunnel souterrain relie le musée à la zone archéologique et permet un parcours unique qui s'étend des anciens fours de cuisson de la céramique aux collections historiques, en passant par les productions du XXe siècle et les espaces dédiés aux conférences, aux activités pédagogiques et aux ateliers, ainsi qu'aux expositions temporaires.